Vous incarnez un jeune homme de 21 ans qui vient d'hériter de la ferme de son défunt grand-père. Alors qu'il se rend dans sa nouvelle propriété pour récupérer des affaires, notre héros rencontre trois fées qui lui demandent de reprendre la ferme et de les aider. Le village doit en effet être détruit dans un an pour être remplacé par un parc d'attractions. À vous de trouver une solution pour le sauver. Harvest Moon : Save the Homeland reprend la gameplay habituel de la saga : vous devrez donc cultiver divers fruits, légumes et céréales tout en élevant des animaux (vaches, poules, chien, cheval) .
Vous disposerez d'une année pour sauver votre village ; passé ce délais, vous assisterez à l'un des 9 dénouements du jeu. Ces fins varieront en fonction des amitiés liées par votre héros.
La version PS2 de cet épisode – qui n'est jamais sortie en Europe – a reçu des critiques positives de la part de la presse.