Gust a prévu différents contenus bonus pour Atelier Meruru Plus (Vita).
Tous les DLC de la version PS3 du jeu seront par exemple inclus directement dans la cartouche du jeu. Rufus, Pamela et Hanna seront des personnages jouables et la zone « Makina Domain » sera accessible.
Le jeu disposera par ailleurs de nouveaux boss et d'événements inédits (dont une confrontation entre Meruru et Astrid, le professeur de Rorona).
Gust a également conçu de nouveaux costumes pour son jeu. Meruru aura par exemple droit à une tenue de Rorona et il sera possible de débloquer un costume supplémentaire en disposant d'une sauvegarde d'Atelier Totori Plus sur votre carte mémoire. Si cette sauvegarde provient d'une partie terminée, vous obtiendrez en plus une arme spéciale.
Atelier Meruru Plus sortira le 20 mars 2013 au Japon.