Il y a en tout 114 ennemis, voici la liste des ennemis rencontrés au cours du jeu (rangés par ordre alphabétique), suivi d'une rapide liste des boss, vu qu'ils sont détaillés dans le cheminement ou les quêtes :
  
   | Nom (* variants) | Localisation | Résistances | Objets (normal, rare, à voler) | EXP | Pts compétence | Gils | 
  
   | Aérocombattant | Bidonville du secteur 7 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Plateau effondré du secteur 7
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faibleese : Feu, Vent Immunité : Stop, Furie
 | Super-potion, Sphère de gravité, Shère de gravité | 158 | 4 | 96 | 
  
   | Aérocombattant spécial | Plateau effondré du secteur 7 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Feu, Vent Immunité : Stop, Furie
 | Méga-potion, Sphère de gravité, Sphère de gravité | 535 | 5 | 320 | 
  
   | Beck | Bidonville du secteur 6 (+colisée) | Faiblesse : Feu | Potion, Boisson de vitesse, Boisson de vitesse | 31 | 3 | 80 | 
  
   | Biobarddox | Plateau effondré du secteur 7 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesses : Glace, Vent | Queue de phénix, Stimulant, Stimulant | 405 | 4 | 178 | 
  
   | Blugu | Plateau du secteur 4 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesses : Foudre, Vent Immunité : Stop
 | Flacon à sels, -, Flacon à sels | 36 | 2 | 42 | 
  
   | Brigand | Bidonville du secteur 6 (+ colisée) | Faiblesse : Feu | Potion, Boisson de vitesse, Boisson de vitesse | 61 | 3 | 80 | 
  
   | Brigand colossal | Bindonville du secteur 5 (après effondrement) Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Feu | Stimulant, Méga-potion, Ceinture du champion | 258 | 5 | 104 | 
  
   | Bombo | Bidonville du secteur 6 (colisée) | Immunité : Feu, Stop, Furie | Bouteille incendiaire, -, Bouteille incendiaire | 116 | 5 | 168 | 
  
   | Burke | Bidonville du secteur 6 (+colisée) | Faiblesse : Feu | Potion, Boisson de vitesse, Boisson de vitesse | 51 | 3 | 103 | 
  
   | Butch | Bidonville du secteur 6 (+colisée) | Faiblesse : Feu | Potion, Boisson de vitesse, Boisson de vitesse | 82 | 3 | 57 | 
  
   | Cancésarino | Egouts du secteur 6 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Glace Résistance : Physique
 | Potion, Calmant, Calmant | 41 | 3 | 93 | 
  
   | Canon laser | Réacteur mako n°5 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Foudre Résistance : Vent
 Immunité : Poison, Sommeil
 | - | 62 | 2 | 11 | 
  
   | Capitaine Konrad | Bidonville du secteur 6 (colisée) | Faiblesse : Feu | Grenade, Calmant, Grenade | 750 | 10 | 375 | 
  
   | Capsule cérébrale | Tour Shinra | Faiblesse : Foudre Immunité : Poison, Stop
 | Produit toxique, Antidote, Antidote | 450 | 5 | 750 | 
  
   | Chien de garde | Réacteur mako n°1 Centre-ville du secteur 8
 Secteur 7
 Tunnel en spirale
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Plateau effondré du secteur 7
 Tour de Shinra
 | Faiblesse : Glace | Potion, Potion, Potion | 32 | 3 | 16 | 
  
   | Chien de l'enfer | Bidonville du secteur 6 (colisée) Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Glace Absorption : Feu
 | - | 198 | 5 | 162 | 
  
   | Combattant | Réacteur mako n°1 Centre-ville du secteur 8
 Secteur 7
 Réacteur mako n°5
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Feu | Potion, Grenade, Grenade | 47 | 4 | 39 | 
  
   | Combattant amélioré | Tour Shinra (+Simulateur de combat) | Résistance : Magie | Grenade, Stimulant, Stimulant | 247 | 1 | 351 | 
  
   | Combattant blindé | Tour Shinra (+Simulateur de combat) | Faiblesse : Foudre Résistance : Physique
 Immunité : Furie
 | Grenade, Calmant, Calmant | 462 | 4 | 975 | 
  
   | Combattant spécial | Réacteur mako n°5 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Feu | Grenade, Super-potion, Super-potion | 91 | 5 | 82 | 
  
   | Cripshé | Cimetière des trains Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Glace | Potion, Super-potion, Super-potion | 45 | 3 | 19 | 
  
   | Dévore-tout* | Bidonville du secteur 5 (après effondrement) Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Glace | Antidote, Super-potion, Antidote | 103 | 3 | 83 | 
  
   | Dogue sanglant | Bidonville du secteur 6 (colisée) Secteur 7 (site d'expérimentation)
 Tour Shinra (+Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Glace | Antidote, Antidote, Antidote | 69 | 3 | 26 | 
  
   | Dompteur de fauves | Bidonville du secteur 6 (colisée) | Faiblesse : Feu | Potion, -, Stimulant | 51 | 1 | - | 
  
   | Dracocampe | Plateau du secteur 4 Bidonville du secteur 7
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Glace | Potion, Super-potion, Potion | 43 | 3 | 54 | 
  
   | Drone annihilateur | Plateau effondré du secteur 7 Tour Shinra (+Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Foudre Immuité : Poison, Sommeil
 | Grenade, Bracelet bouclier, Bracelet bouclier | 540 | 5 | 245 | 
  
   | Drone mitrailleur | Tunnel en spirale Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Plateau effondré du secteur 7
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Foudre, Vent Immunité : Poison, Sommeil
 | Super-potion, Sphère de gravité, Sphère de gravité | 35 | 2 | 54 | 
  
   | Drone paralyseur | Plateau effondré du secteur 7 Tour Shinra
 | Faiblesse : Foudre Immunité : Poison, Sommeil
 | Super-potion, Sphère de gravité, Sphère de gravité | 105 | 2 | 166 | 
  
   | Dynneglauh | Bidonville du secteur 7 Cimetière des trains
 Plateau effondré du secteur 7
 | Faiblesse : Vent | Sphère de gravité, Queue de phénix, Ether | 73 | 5 | 76 | 
  
   | Fantôme | Cimetière des trains Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Feu Résistance : Glace
 Immunité : Silence, Stop
 | Ether, Turbo-éther, Turbo-éther | 102 | 3 | 32 | 
  
   | Fumifacturier | Bidonville du secteur 5 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Foudre | Produit toxique, Ecran d'écho, Ecran d'écho | 95 | 5 | 69 | 
  
   | Garde | Réacteur mako n°1 Centre-ville du secteur 8
 Secteur 7
 Réacteur mako n°5
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Feu | Potion, Grenade, Grenade | 22 | 2 | 10 | 
  
   | Garde antiémeute | Centre-ville du secteur 6 Secteur 7
 Réacteur mako n°5
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Feu | Grenade, Calmant, Grenade | 28 | 2 | 12 | 
  
   | Garde antiémeute d'élite | Réacteur mako n°5 Bidonville du secteur 7
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Tour de Shinra
 | Faiblesse : Feu | Grenade, Calmant, Grenade | 83 | 3 | 49 | 
  
   | Garde d'élite | Bidonville du secteur 7 Secteur 7
 Réacteur mako n°5
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Plateau effondré du secteur 7
 Tour de Shinra
 | Faiblesse : Feu | Potion, Super-potion, Super-potion | 42 | 3 | 34 | 
  
   | Garde pyrotechnicien | Tunnel en spirale Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Feu Résistance : Physique
 | Potion, Super-potion, Super-potion | 51 | 3 | 59 | 
  
   | Grenadier | Centre-ville du secteur 8 Secteur 7
 Tunnel en spirale
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Feu | Grenade, Stimulant, Grenade | 18 | 2 | 26 | 
  
   | Grenadier d'élite | Secteur 7 Tunnel en spirale
 Réacteur mako n°5
 Bidonville du secteur 7
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Plateau effondré du secteur 7
 Tour de Shinra
 | Faiblesse : Feu | Grenade, Stimulant, Grenade | 31 | 3 | 68 | 
  
   | Homme louche | Bidonville du secteur 7 | Faiblesse : Feu | Grenade, -, Stimulant | 42 | 1 | 75 | 
  
   | Insecte étrange | Bindonville du secteur 7 (site d'expérimentation) Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Vent | - | 16 | 1 | 10 | 
  
   | Lacérateur | Tour Shinra (+Simulateur de combat) | Faiblesses : Foudre, Vent Immunité : Poison, Sommeil
 | -, -, Bracelet en métal lourd | 750 | 6 | 500 | 
  
   | Lance-missiles | Tunnel en spirale Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Foudre Résistance : Vent
 Immunité : Poison, Sommeil
 | Sphère de gravité, -, Sphère de gravité | 77 | 3 | 46 | 
  
   | Lézard volant | Bidonville du secteur 7 Bidonville du secteur 6 (+ colisée)
 Cimetière des trains
 | Faiblesse : Vent | Potion, Sphère de gravité, Queue de phénix | 52 | 3 | 50 | 
  
   | Mange-tout | Bidonville du secteur 7 Bidonville du secteur 5
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Glace, Magie | Potion, Antidote, Antidote | 43 | 3 | 59 | 
  
   | Marteleur | Tour Shinra (+Simulateur de combat) | Faiblesse : Foudre Résistance : Vent
 Immunité : Poison, Sommeil
 | Sphère de gravité, Ecran d'écho, Ecran d'écho | 600 | 7 | 275 | 
  
   | Mitrailleuse | Bidonville du secteur 7 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Tour Shinra
 | Faiblesse : Foudre Résistance : Physique, Vent
 Immunité : Poison, Sommeil
 | - | 92 | 2 | 17 | 
  
   | Mitrailleuse prototype | Plateau du secteur 4 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Foudre Résistance : Vent
 Immunité : Poison, Sommeil
 | - | 51 | 3 | 43 | 
  
   | Molosse errant* | Bidonville du secteur 7 Secteur 7 (site d'expérimentation)
 | Faiblesse : Glace | - | 20 | 8 | 266 | 
  
   | Nettoyeur | Réacteur mako n°1 Secteur 7
 Réacteur mako n°5
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Secteur 7 (site d'expérimentation)
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Foudre Immunité : Poison, Sommeil
 | Queue de phénix, Ether, Ether | 66 | 5 | 49 | 
  
   | Nettoyeur prototype | Bidonville du secteur 6 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Foudre Immunité : Poison, Sommeil
 | Queue de phénix, Turbo-éther, Turbo-éther | 32 | 6 | 788 | 
  
   | Prince sahuagin* | Egouts du secteur 6 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Feu | - | 72 | 6 | 800 | 
  
   | Proto-trypapollis | Bidonville du secteur 6 (route effondrée quête chocobo chp14) | Faiblesse : Glace | - | 59 | 5 | 648 | 
  
   | Rat géant* | Bidonville du secteur 7 | Faiblesse : Glace | - | 20 | 3 | 114 | 
  
   | Rat-garou | Bidonville du secteur 7 Tunnel en spirale
 Bidonville du secteur 5
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Egouts du secteur 6
 Cimetière des trains
 | Faiblesse : Glace | Potion, Ether, Antidote | 19 | 1 | 8 | 
  
   | Rejeton chapardeur* | Egouts du secteur 6 | Faiblesse : Feu | Produit toxique, Antidote, Antidote | 173 | 2 | 390 | 
  
   | Rejeton d'Apsu | Egouts du secteur 6 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Feu | Produit toxique, Antidote, Antidote | 341 | 2 | 390 | 
  
   | Sahuagin | Egouts du secteur 6 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Feu | Potion, Stimulant, Stimulant | 125 | 4 | 65 | 
  
   | Sans-nom | Secteur 7 (site d'expérimentation) Tour Shinra (+Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Glace Résistance : Foudre
 Immunité : Poison, Stop
 | - | - | - | - | 
  
   | Sbire de Cornéo | Bidonville du secteur 6 (colisée) | Faiblesse : Feu | Grenade, -, Stimulant | 51 | 1 | 34 | 
  
   | Scorpiomante | Tunnel en spirale Plateau du secteur 4
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Glace | Soie d'araignée, Super-potion, Soie d'araignée | 53 | 3 | 39 | 
  
   | Scorpiomante reine | Tunnel en spirale Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Glace | Soie d'araignée, Super-potion, Soie d'araignée | 153 | 6 | 14 | 
  
   | SOLDAT 3e classe | Plateau effondré du secteur 7 Tour Shinra (+Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Feu | Méga-potion, Turbo-éther, Turbo-éther | 473 | 6 | 261 | 
  
   | Spectre* | Bidonville du secteur 5 (Quête les enfants disparus) Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Feu Résistance : Glace, Dégâts proportionnels
 Immunité : Silence, Stop
 | - | 58 | 4 | 616 | 
  
   | Tétarosor | Bidonville du secteur 5 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Glace | Super-potion Ether, Ether | 55 | 3 | 38 | 
  
   | Tétarosor roi* | Bidonville du secteur 5 | Faiblesse : Glace | - | 32 | 7 | 252 | 
  
   | Tomberry | Bidonville du secteur 5 (Quête Des sbires vindicatifs) | Immunité : Poison, Silence, Furie | Elixir, -, Elixir | 186 | 7 | 154 | 
  
   | Toxicodisperseur* | Bidonville du secteur 5 | Faiblesse : Foudre Immunité : Poison, Sommeil
 | - | 32 | 10 | 420 | 
  
   | Tronçonneur | Réacteur mako n°5 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 Secteur 7 (site d'expérimentation)
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Foudre Immunité : Poison, Sommeil
 | Ecran d'écho, Queue de phénix, Ecran d'écho | 119 | 5 | 96 | 
  
   | Tronçonneur trafiqué | Bidonville du secteur 6 (colisée) | Faiblesse : Foudre Immunité : Poison, Sommeil
 | Ether, -, Turbo-éther | 475 | 9 | 708 | 
  
   | Trypapollis* | Bidonville du secteur 6 (route effondrée quête chocobo chp14) Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Résistances : Physique, Magique | - | 59 | 5 | 648 | 
  
   | Vagidopollis | Bidonville du secteur 5 (après effondrement) Secteur 7 (site d'expérimentation)
 Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Glace | Queue de phénix, Calmant, Calmant | 71 | 4 | 65 | 
  
   | Venimante* | Bidonville du secteur 5 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Glace | - | 32 | 4 | 252 | 
  
   | Vigiforeuse* | Bidonville du secteur 5 Secteur 7 (site d'expérimentation)
 Tour Shinra
 | Faiblesse : Vent Immunité : Stop
 | Super-potion, Turbo-éther, Turbo-éther | 32 | 4 | 101 | 
  
   | Vigilaser | Réacteur mako n°1 Secteur 7
 Bidonville du secteur 6 (colisée)
 | Faiblesse : Foudre Résistance : Vent
 Immunité : Poison, Sommeil
 | - | 17 | 1 | 10 | 
  
   | Vigivrille | Réacteur mako n°1 Réacteur mako n°5
 Secteur 7 (site d'expérimentation)
 Tour Shinra (+Simulateur de combat)
 | Faiblesse : Vent Immunité : Stop
 | Potion, Ether, Ether | 22 | 3 | 21 | 
  
   | Wyverne tigrée* | Bidonville du secteur 5 (Quête A la recherche des chocobos en fuite) Tour Shinra (Simulateur de combat)
 | Absorption : magie | - | 56 | 7 | 616 | 
  
   | Zenene | Tour Shinra (+Simulateur de combat) | Résistance : Feu | Ether, Produit toxique, Remède | 357 | 5 | 98 | 
Voici la liste des boss rencontrés au cours de l'histoire et des quêtes (listés dans l'ordre du bestiaire du jeu) :
Capsule cérébrale, Lamipède, Morbol, Rochey, Réno, Rude, Rufus, Ténébro, Scorpion gardien, Sacarabombardier, Aérodestructeur, Gyrocanonner, Hectoncanonnier, Prestige ver. 0, Spéciment H0512, Spécimen H0512-OPT, Jénova-PULSATION, Maison infernale, Apsu, Meistergeist, Eligor, Anonyme, Béhémoth type zéro, Shiva, Gros chocobo qui est accompagné de ???? (bombo noir), ??????? (tomberry noir) et Pampa, Léviathan, Bahamut, Ifrit, Créature inconnue, Créature du néant, et les 5 boss finaux surnommés "chef, rouge, bleu, vert, bahamut" et le boss final.