Le jeu propose une nouvelle histoire originale qui tourne autour des « Médailles Ooja ». Le protagoniste du jeu est le joueur, qui peut librement personnaliser son avatar. Les joueurs pourront former leurs amis yo-kai, lutter contre d'autres utilisateurs en mode de combat en temps réel, chercher des yo-kai en utilisant une fonctionnalité de réalité augmentée et prendre et partager des photos.