Le 1er novembre 2012, une version HD regroupant Yakuza et Yakuza 2 sort sur PlayStation 3. Au-delà de l'aspect graphique et du ratio de l'image, l'éditeur annonce des temps de chargement optimisés ainsi que quelques options supplémentaires. Il sera ainsi possible de réarranger ses objets à partir des bornes téléphoniques ou bien de voir la liste des plats consommés dans les différents restaurants. Un patch sortira le 1er novembre 2012 proposant un mode Easy et permettant d’accélérer le remplissage de la jauge de Heat. Quelques mois plus tard, le 8 août 2013, le jeu HD sort sur Wii U. En plus des mêmes améliorations que la version PS3, cette version est intégralement jouable sur le Wii U GamePad. Il s'agit là de la première incursion de la série sur un support autre qu'une console Sony. Que ce soit sur PlayStation 3 ou sur Wii U, ce portage HD n'est pas sorti du territoire japonais.