« Suite au phénomène appelé “Apocalypse” qui a détruit un monde en plein désarroi, et face à sa mort imminente, un jeune garçon nommé Sid croise la route de Torii, une fille qui se nourrit de l'énergie du temps. Dans la ville portuaire d'Astella, une aventure mystérieuse est sur le point de se dérouler ainsi qu’une enquête sur un crime inhabituel… Chronus, une nouvelle espèce apparue soudainement après l'Apocalypse, a la capacité de manipuler le temps. Une fois lié par le mystérieux "Pacte Chrono", un Chronus pourra atteindre sa puissance maximale à mesure que ses liens avec le "Lié" se renforcent. Le Chronus est-il juste une arme, ou un partenaire en qui il est possible d’avoir confiance ? La réponse à cette question n'a pas encore été trouvée. Afin d'enquêter sur un crime étrange, Sid et Torii se lancent ensemble dans un voyage vers l'inconnu. Dans cet entrelacement complexe d'événements, chaque décision prise pourrait façonner l'avenir d'Astella. »
Souls of Chronos offre aux joueurs une expérience de jeu RPG classique. En plus des options d'action et de dialogue qui peuvent déterminer la suite de l'histoire, le monde propose également une grande variété de quêtes secondaires. Terminez des quêtes secondaires en échange de récompenses pour améliorer vos armes ou personnaliser vos personnages. Gardez bien à l’esprit qu’une petite chose insignifiante peut influencer le cours des événements. Bien sûr, le duo rencontrera également des ennemis dangereux : préparez vos armes, libérez la puissance de Chrono et écrasez tous les ennemis qui se trouvent sur votre chemin.