Genso Suikoden Tsumugareshi Hyakunen no Toki nous contera l'histoire d'un groupe de personnages qui se rassemble pour vaincre une terrible bête qui apparaît tous les 100 ans et détruit tout. Le personnage principal sera apparemment envoyé 100 années en arrière par une fille mystérieuse nommée Zephon. Konami a profité du TGS 2011 pour dévoiler un nouvel épisode de la saga des Suikoden, intitulé Genso Suikoden Tsumugareshi Hyakunen no Toki.
Ce RPG emploie un système de jobs secondaires.
Durant un événement se déroulant lors d'un dîner dans votre QG vous pourrez ainsi accéder à des jobs qui vous permettront de changer le type d'équipement que vous portez.
Un magicien pourra par exemple utiliser un arc grâce à ce procédé.
De nombreuses classes seront présentes dans le jeu : lancier, forgeron, archer, chimiste...
Konami a également prévu un système de craft permettant de réaliser des armes, des items de soin et des pierres magiques.
Vous pourrez utiliser six personnages lors des combats : trois « maîtres » et trois « apprentis ». Les combats, se déroulant au tour par tour, s'axeront autour de « points de volonté » qui seront utilisés pour réaliser nos actions. Vous récupérerez une partie de votre « volonté » après chaque tour.