Après avoir fini le temple de la forêt et avoir appris le prélude de la lumière au temple du temps, vous pouvez redevenir enfant et allez dans la forêt Kokiri vous mettre face à votre lit pour accéder au Boss Challenge.

Cela vous permet de combattre en un temps limité tous les boss de l'aventure déjà combattus. Pour les affronter à la suite, vous devez les vaincre tous au moins une fois dans le mode Boss Challenge.

Voici les récompenses que vous pouvez obtenir en choisissant entre le petit et le grand coffre. Il n'y a pas de récompense pour les tuer à la suite.

Vous débutez avec 5 coeurs, la barre de magie entière, les 3 boucliers et tuniques, le lance-pierre, le boomerang, l'arc, le grappin, la masse des titans, 30 flèches, les petits sacs de bombes et de graines (non remplis), le bracelet de force et le monocle de vérité.