Atelier Meruru permet d'incarner Meruru (Meryl ou Merle en version « occidentalisée ») , une jeune fille âgée de 15 ans qui n'est ni plus ni moins que l'apprentie de Totori (19 ans) , l'héroïne du second volet des épisodes Alchemist of Arland. Gust a profité du Game Dengeki Appreciation Festival 2011 pour dévoiler un nouvel épisode de la série Atelier. Intitulé Atelier Meruru, ce RPG est la suite d'Atelier Rorona et d'Atelier Totori bien qu'il ne se déroule pas à Arland mais dans un petit pays voisin nommé « Earls ».
Rorona fait d'ailleurs partie du casting du jeu mais elle a l'apparence d'une petite fille ce qui est bien surprenant quant on sait que cette demoiselle fut le professeur d'alchimie de Totori ! Il appartient donc aux joueurs d'éclaircir ce mystère au cours du jeu.
Atelier Meruru s'appuie sur un système de combat se démarquant assez nettement de celui de ses aînés. Ainsi, le traditionnel tour par tour de la série est remplacé ici par un système où l'ordre des actions est fonction du « coût » des techniques que l'on utilise.
Le jeu dispose également d'autres nouveautés : un système permet de faire évoluer le monde dans lequel Meruru évolue et dans un registre différent, il est possible de « customiser » légèrement nos recettes alchimiques en modifiant leurs ingrédients.
Atelier Meruru met un terme au « storyline » des épisodes Arland.