Cette version existera en parallèle de Phantasy Star Online 2, car de nombreux éléments de gameplay diffèrent entre ces deux versions. L’idée derrière ce titre est de conserver les éléments du jeu de base, tout en repensant intégralement l’aspect graphique, le gameplay et les mécaniques du jeu. Les développeurs promettent une personalisation des avatars encore plus grande, ainsi qu’un monde vivant et immense à découvrir. A noter que Phantasy Star Online 2 : New Genesis sera également un free-to-play. La PS4 et la Switch proposeront le jeu uniquement en version Cloud au Japon.