Level-5 a annoncé que Inazuma Eleven Go 2 : Chrono Stone – Raimei (Thunder) et Inazuma Eleven Go 2 : Chrono Stone – Neppuu (Hot Wind) sortiront le 13 décembre 2012 au Japon sur 3DS.
Ces deux versions auront pour héros Tenma, le personnage principal de Inazuma Eleven Go.
L'histoire de Chrono Stone débutera lorsque Tenma se retrouvera au Collège Raimon dans une dimension parallèle où le cours des événements sera bien différent de celui du monde dont il vient. Notre héros devra alors affronter des être malfaisants pour sauver l'avenir du football !