Pokémon Mystery Dungeon : Magna Gate and the Infinite Labyrinth sortira à la fin de l'année au Japon sur 3DS. Le jeu sera intégralement en 3D et il semblerait que les modèles utilisés pour ce dernier soient les mêmes que ceux du Pokédex 3D.
Le jeu reprendra de nombreux aspects des titres précédents de la série ; il s'agira toujours d'un rogue-like et l'intrigue restera la même : vous serez transformé en Pokémon et vous vous réveillerez dans leur monde.
Vous pourrez incarner un Pikachu, un Moustillon, un Coupenotte, un Vipelierre ou un Gruikui. Vous ferez équipe avec l'une de ces créatures également.
Tout au long du jeu, vous devrez accepter des quêtes et explorer des donjons. Une nouveauté est néanmoins prévue : vous pourrez générer des entrées pour des antres nommées « Magna Gates » en pointant l'appareil photo de la 3DS sur des objets ronds pour les « scanner ». Ces donjons seront générés aléatoirement et seront donc différents à chaque fois que vous pénétrerez dedans.
Vous devrez une nouvelle fois venir en aide à des Pokémon dans des donjons remplis d'items, de puzzles et de pièges.
L'histoire de ce nouvel opus sera apparemment plus « dramatique » et complexe que celles des jeux principaux de la licence.
Notons pour finir que des Pokémon des versions Blanche/Noire 2 seront présents dans ce jeu.